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Bionano Genomics最新标记技术(DLS)公测版用户在第26届国际动植物基因组大会上发表突破性研究成果

版权所有,转载请联系基因市场部
2018-01-25

美国圣地亚哥 2018年1月12日报道(转自GLOBE NEWSWIRE),近年来一直致力于开发基因组图谱技术的领先企业Bionano Genomics公司(以下简称Bionano)今天宣布, 1月13日至17日间在美国加州圣地亚哥举行的每年一度的第26届国际动植物基因组大会(PAG XXVI)上,将有16个会议报告和23张研究海报详细报道基于Bionano基因组图谱的最新研究进展。同时在这次大会上,将有数个会议报告对Bionano即将在第一季度发布的最新标记技术——DLS(Direct Labeling and Staining)试剂盒进行详细的公测报道。DLS标记技术以及与其配套的试剂盒和分析软件的发布将进一步提高基因组组装数据的完成度和精确度。不同于目前主流的基于切刻内切酶的NLRS标记技术,最新的DLS标记技术不对双链DNA进行切刻标记且不产生任何物理损伤,因此避免了NLRS标记技术中由于DNA正负链切刻位置重叠而造成的双链DNA片段的断裂(fragile sites)——从而限制了基因组图谱的组装长度(Map N50)。于此同时,DLS标记密度的增加进一步提高了基因组图谱的组装长度(Map N50)和组装精度(DNA分子和contig的位置、顺序及方向),从而轻松获得覆盖整个染色体臂的超长图谱。经过仅仅不到两个月的公测,已经有十几个测试用户表示他们所获得的初步试验数据证实,DLS标记技术与现行NLRS标记技术相比,图谱长度(Map N50)可增加高达50倍,且保持Bionano一贯的组装准确性。以DLS标记技术为基础的scaffold N50已经达到或超过100 Mbp,这将成为基因组组装的全新标准。

 

       Bionano基因组图谱可以鉴别不同个体、种植群体、选育品系和物种间的基因组结构变异,也可以用于构建白金级参考基因组。目前许多scaffolding技术通过增加更多复杂的基因组测序数据来增加和完善参考基因组的长度,而Bionano的从头组装(de novo)技术仅仅需要1000美金,就可在短短几天内、不依赖于任何测序序列组装出染色体臂长度的基因组图谱。也正因为Bionano的从头组装不依赖于任何序列,因此可以用于矫正和验证基因组序列组装的准确性和完整性,从而保证了所创建基因组参考序列的质量。

 

       Bionano公司的博客Bionano U里提供了将在PAG会议中发表的全部39个会议报告和研究海报的详细信息。其中包括Bionano公司研究人员关于DLS标记技术的会议报告(W025),洛克菲勒大学脊椎动物基因组研究实验室(P0204)、法国国家测序中心Genoscope(P0176)等研究海报。其中,Bionano在PAG的会议报告将会着重展示十几种已经完成DLS组装的物种,包括鱼类、鸟类、小麦、玉米、油菜、哺乳动物和人类等。

 

       Bionano首席商务官Warren Robinson表示,随着DLS的市场发布,Bionano将为基因组组装设立更高的行业新标准。PAG XXVI会议上创纪录的基于Bionano技术组装各种生物基因组的研究报告证明Bionano图谱是世界各国基因组研究者和医疗工作者不可缺少的研究工具。DLS将帮助我们不断提高动植物基因组组装的准确性和完整性。我们相信2018年将会是Bionano令人振奋的一年,同时也将是整个基因组领域蓬勃发展的一年。

 

详情请垂询Bionano在PAG的展台#523或浏览Bionano PAG XXVI网页https://bionanogenomics.com/bionano-university/articles/pagxxvi/

(长按并复制后,在浏览器中打开)

 

关于Bionano Genomics

       总部位于美国圣地亚哥的Bionano Genomics公司,一直致力于提供更好地获取全面基因组信息的解决方案,最近推出了高通量基因组图谱绘制系统Saphyr™系统可以收集海量超长DNA分子信息来绘制基因组图谱。Bionano基因组图谱实现了对结构变异的全面深入诠释,对所有类型的结构变异检测灵敏度均大大超过了以测序为基础的检测方法。结合测序数据,Bionano图谱可以校正组装序列、提供组装序列的排列顺序和方向等重要信息,并组装出高质量基因组参考序列。

 

基因有限公司作为Bionano公司中国区代理商以及PacBio公司中国区独家代理商,我们为您基因组研究领域提供最完整的解决方案,也为国内用户提供专业的三代测序系统、单分子光学图谱系统的安装培训,技术支持,应用培训与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的BioNano及PacBio用户。

 

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