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FFPE样本也可高效做ChIP,获得合适染色质片段仅需40min!

版权所有,转载请联系基因市场部
2018-08-09

    福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)临床样本是目前疾病分子层面及临床研究的重要样本库来源。然而FFPE样本本身也存在着核酸降解严重、脱蜡困难、抽提效率低的问题。ChIP技术是用于检测DNA与蛋白质体内相互作用的经典方法,要得到一个好的ChIP结果也是要经过长时间的摸索,用FFPE样本做ChIP可以说是一项巨大的挑战。ChIP实验难,用FFPE样本做ChIP则是难上加难! 

https://timgsa.baidu.com/timg?image&quality=80&size=b9999_10000&sec=1533293273267&di=be62da0f6bcb5b9d375550c0e4a92a0d&imgtype=jpg&src=http%3A%2F%2Fimg1.imgtn.bdimg.com%2Fit%2Fu%3D3431271551%2C2767929355%26fm%3D214%26gp%3D0.jpg

如果能建立一种高效简便可重复的FFPE样本做ChIP的实验方法,那我们便能够利用现有的FFPE样本库进行疾病表观遗传学变化的研究,为治疗干预寻找新的靶点打下坚实基础。近日Covaris新开发出了一个简单、快速、重复性高、可规模化的利用FFPE样本提取染色质后下游进行ChIP实验的方案,使得这一设想成为现实!


这个整合创新的流程有多简便呢?看下图!左边truChIP FFPE是Covaris 开发的新型流程,右边FFT Protocol是传统流程。truChIP FFPE仅需40min即可从FFPE样本中得到正确剪切的染色质片段,而传统流程需要120min! 40min VS 120min省心省时,省力省的不止一点点!

 

1.  Covaris FFPE ChIP流程 VS 传统流程操作和时间对比

http://img.xiumi.us/xmi/ua/4s6c/i/0aff75f1a2dcad428ecb1d124e9483c0-sz_6086.png?x-oss-process=style/xmorienthttp://img.xiumi.us/xmi/ua/4s6c/i/2abaa54e59a92a2a82a0d1d89cddbe8e-sz_6505.png?x-oss-process=style/xmorient

    Covaris 借助AFA聚焦超声技术,结合其truXTRAC FFPE和truChIP染色质剪切试剂盒的优势,将二者整合优化,成功建立了简便高效的FFPE样本ChIP实验流程。

还不了解这两个FFPEChIP方案的同志们可以戳这里回顾下。

(怎么办?我的ChIP为何屡屡失败?)

(看这里,FFPE样本核酸提取秘笈!)

想看看这个方法如何操作实现的?具体结果如何?跟传统方法对比怎样?戳下方阅读原文链接一看究竟吧!更可在原文链接内点击索取详细实验protocol噢!

利用FFPE样本做ChIP的新型简便实验流程http://www.ebiotrade.com/newsf/2018-8/201883180914892.htm

 

基因有限公司作为Covaris中国区的独家代理商,竭诚为您提供AFA技术的精彩应用,更多相关资料请联系基因有限公司相关人员或登录基因有限公司网站进行了解~

 

 


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