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Covaris FFPE核酸提取升级试剂盒来了,超高性价比欢迎试用!

版权所有,转载请联系基因市场部
2020-11-13

   基因有限公司代理的Covaris 新推出升级版truXTRAC FFPE total ultra 试剂盒,对一个样本可同时提取DNA和RNA。新版ultra kit 中的超声管和试剂相比旧版都进行了升级,性能得到提升的同时,价格下降近一半,为您提供更加优化、性价比更高的FFPE核酸提取解决方案!如果您感兴趣试用或想要了解更多信息,欢迎联系我们!

试剂盒升级DNA质量对比

试剂盒升级RNA质量对比

       取两组相同肾脏、肝脏来源FFPE样本,每个蜡卷均来自同一蜡块,每组样本做6个重复,左边AFA-TUBE 0.5ml 为升级版ultra kit 提取结果,右边microTUBE-500为旧版kit提取结果。结果显示Covaris FFPE truXTRAC FFPE total ultra kit 升级后在DNA/RNA 得率、完整性等方面均有提升。

Covaris FFPE truXTRAC FFPE total ultra kit 提取DNA/RNA 流程,试剂盒内包含AFA-TUBE PP Screw-Cap 0.5 ml 超声管,超声彻底脱蜡仅需7min!

AFA 超声脱蜡更彻底

相信很多人都遇到过提取FFPE核酸样本难脱蜡的情况,有时候要重复脱蜡两遍甚至过夜脱蜡。脱蜡过程中还需要使用二甲苯、矿物油等有机溶剂,有毒且难以彻底脱蜡,稍微厚一点的(>10μm)组织切片更加难以渗透,脱蜡效率就更低了。因为石蜡成了阻碍下一步蛋白酶K消化的屏障,所以组织消化也不够。此外,二甲苯还容易造成核酸降解,本就量少的FFPE样本经过这么一折腾最后的核酸得率质量都受很大影响,也许很多意想不到的基因信息就这么不经意的丢失了。

       利用Covaris AFA超声技术来对FFPE样本进行超声乳化脱蜡,想象一下,有聚焦超声的帮助,裂解液和蛋白酶K能够由内而外、由外向内的全方位无死角侵入组织内部脱蜡乳化、组织消化,这样纳米级别的处理当然使得样品脱蜡消化更彻底!

      一起来看看Covaris truXTRAC FFPE 核酸提取解决方案的超声脱蜡过程吧,仅需7min,FFPE样本内的白色石蜡颗粒全部溶解出来,你很有必要了解一下!点击下方10秒小视频,简单了解下吧!


简单标准可自动化的提取流程!

样本收集到核酸纯化<3h,同一样本,可同时提取DNA和RNA,简单化操作流程,纯化可选柱纯化和自动磁珠富集,易于自动化规模化;可选NGS片段化步骤,核酸提取到片段化全程单管操作,无需转移,减少污染与样本损失。

更高的RNA DV200值

illumina 推荐用大于200nt RNA片段所占比值即DV200值来评估用于illumina文库构建的RNA样本质量,DV200值小于30%的样本不推荐用于文库构建,随着DV200值越高,RNA input量可以减少。从下图可以看出,使用Covaris 提取的FFPE样本RNA DV200值均符合建库要求。

Figure 1. Illumina uses 30% DV200 cut-off. DV200: Distribution Value 200, which is the percentage of RNA fragments larger than 200 nucleotides. (Levy, S. The ORIEN

Project- Large Scale Integration of FFPE Material into a Multisite Research Alliance. Oral presentation at AACR 2019; April 1, 2019)

更高的测序覆盖度

下图为FFPE肾脏样本与新鲜样本提取DNA全基因组测序覆盖度比较:其中横坐标表示染色体,浅色为覆盖度小于10x的区域,深色为覆盖度大于10x的区域,Covaris truXTRAC提取的样本,测序覆盖度更加均一,更接近新鲜的冰冻样本!

Figure 2. Whole Genome Sequencing Results (Chromosome 19 Coverage) Comparison Covaris truXTRAC, Competitor and fresh frozen tissue.Sequencing track from Q FFPE kit (red), Covaris (green) extracted FFPE kidney DNA, and fresh frozen (indigo) samples were loaded on the IGV viewer, and the coverageanalyzed for chromosome 19. Coverage of >10x are indicated in dark colors, coverage of <10X are indicated in light colors. Chromosomal view of coverage indicates

that Covaris extracted DNA quality resembles that of the DNA extracted from fresh frozen tissue.

升级还降价,高性价比之选

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可自动化

 高得率

可DNA/RNA 共提

  RNA 高DV200值

低样本起始量

低QNS率(无法诊断样本)

无需有机溶剂脱蜡

 高测序覆盖度

超声脱蜡水解更彻底

改进融合基因的检测

近年来引用文献不断增加中

      12月10日上午9:00-10:00,我们将邀请Covaris 首席科学家Hamid Khoja,博士为我们带来Standardizing FFPE Nucleic Acid Extraction for Clinical Cancer Genomics的线上讲座,为大家详细介绍ultra kit 的数据表现!会议链接届时请点击阅读原文链接。

如需试用或想要了解更多,欢迎扫码联系我们的产品经理咨询,关于Covaris 有任何问题也欢迎咨询!

       基因有限公司作为Covaris公司中国的合作伙伴和全国代理商,为您提供DNA 片段化、ChIP实验、FFPE样本核酸提取、蛋白提取解决方案等。基因有限公司的宗旨是“专才为专家服务”,有专业团队为各大科研机构提供安装培训,技术支持,应用培训与售后维护一条龙服务,赢得客户的一致好评与信任。想要了解更多,请关注我们的官方微信“基因快讯”或联系您身边的基因有限公司员工。


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