当前位置:首页 > 技术交流 > 最新应用

技术交流

扫描二维码
或添加“GeneGroup003
获取更多更新资讯

商城订购

扫描二维码
或添加“基因商城(GeneMart)
手机下单,快人一步

售后服务

扫描二维码
或添加“GeneGroup005
获取更快速售后支持

您的Visium空间转录组生信分析,请查收~

版权所有,转载请联系基因市场部
2021-03-25

随着Visium空间转录组的广泛推广和应用,目前受到越来越多的实验室研究人员的推崇和认可,解决了一个又一个难题。其强大功能的背后,不仅有高科技的芯片技术,更为重要的是其数据分析和处理功能。


Visium空间转录组技术对于得到的转录组数据提供了官方的数据分析方法,基于整体转录组的聚类,基因集团上海贝晶生物技术有限公司(简称上海贝晶)作为Visium空间转录组方案厂家认证的中国服务商,针对于整体转录组的聚类,采用了更优秀的聚类算法,同时在标准分析里还包含共表达分析以及基于空间信息的差异基因检出,接下来为大家一一进行介绍。

基于整体转录组的聚类(更优秀的聚类算法)

基于spot(空间位置点)的一种聚类,通过每个spot内不同基因表达模式,进行转录组间的聚类,通过Marker基因明确细胞类型,更加明确基因之间的调控关系,并检测基因调控网络的显著性

基于基因水平的聚类New

图片
基于基因水平的聚类,准确的共表达变化的基因对,兼顾了相邻基因的识别信息以及定量的共表达改变信息,更加擅于识别共表达的改变,避免遗漏部分差异表达不显著却有着重要生物学意义的基因,更加明确一些基因的生物特性、基因调控网络之间的关系及基因功能和意义。

基于空间信息的差异基因检出New

图片

基于其空间位置信息的差异基因表达的聚类,准确获得组织中不同区域的细胞构成和基因表达状态,以及不同功能区之间的基因差异表达等信息。

图片

Loupe Browser是10×Genomics推出的一款用于后续数据的交互式可视化的操作软件,适用于Windows和Mac OS的桌面应用程序能够将基因表达数据层加到H&E图像上,从而快速了解数据的底层生物学知识。

欢迎留言获取Loupe Browser演示视频!

基因集团上海贝晶生物技术有限公司(简称上海贝晶)作为Visium空间转录组方案厂家认证的中国服务商,十多年来一直致力于转录组服务及相关数据分析,为未来深度挖掘多组学空间结构信息打下坚实基础,服务用户发了很多高质量的论文, 不乏在署名作者以及致谢中提及我司及生信人员的例子。

图片
图片


完善的实验平台——官方推荐认可的仪器设备及试剂

优秀的技术团队——国内知名高校的资深实验团队以及具备自主研发软件的生信团队

一站式的服务——提供从组织切片、染色、透化、文库构建、测序到数据分析以及结果可视化的全程服务

  Let Professionals Serve Professionals!


欢迎关注我司“基因快讯”与“基因售后服务”官方微信

沪公网安备 31010402003540号

沪ICP备19021954号-2